南京中医药大学第五轮学科评估完整结果目前还未公示。作为参考，在教育部第四轮学科评估中，南京中医药大学共有6个学科获得评级，其中中医学、中西医结合、中药学获评A-，为学校评级最高的学科。
南京中医药大学第四轮学科评估结果完整名单
教育部第四轮学科评估中，南京中医药大学一共6个学科上榜，其中3个A-学科、1个B+学科、1个B-学科、1个C-学科。
| 序号 | 院校名称 | 学科名称 | 评估结果 |
|---|---|---|---|
| 1 | 南京中医药大学 | 中医学 | A- |
| 2 | 南京中医药大学 | 中西医结合 | A- |
| 3 | 南京中医药大学 | 中药学 | A- |
| 4 | 南京中医药大学 | 护理学 | B+ |
| 5 | 南京中医药大学 | 药学 | B- |
| 6 | 南京中医药大学 | 公共管理 | C- |
从评级较高的学科来看，南京中医药大学的中医学、中西医结合、中药学获评A-，护理学获评B+，药学获评B-，这些学科均为该校的优势学科。
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